A hónap összességében szárazabb volt a megszokottnál, viszont jelentős különbségek adódtak az országon belül. A havi csapadékösszeg országos átlagban 40,7 mm volt, amely a sokévi átlag 69%-a. A szárazabb területek a Duna-Tisza közébenben, valamint délen találhatóak. Itt 25 mm alatt alakult a havi összeg. A legszárazabb térségekben 15 mm-nél kevesebb hullott, sőt 10 állomásunkon a 10 mm-t sem érte el az összeg. A havi legalacsonyabb csapadékösszeget, 5,8 mm-t a Bács-Kiskun vármegyei Bácsbokodon regisztráltuk. A csapadékban gazdagabb területek a Nyugat-Dunántúlon és az Északi-középhegységben fekszenek. Errefelé 70 mm feletti havi értékek jellemzőek. A havi legmagasabb összeg Borsod-Abaúj-Zemplén vármegyében, Bükkszentkereszten 130,7 mm volt. A hónap legnagyobb 24 órás csapadékösszegét, 74,0 mm-t pedig szeptember 9-én mértük, Bátonyterenyén.

Szeptemberben a lehulló csapadékmennyiség hazánk közel kétharmadán elmaradt az 1991-2020-as átlagértéktől. A hiány mértéke dél felé haladva nőtt. A csapadékban legszegényebb területek a Mecsek és Mohács tágabb környezetében találhatóak: itt a megszokott mennyiség 10-20%-a hullott mindössze. Csapadéktöbblet nagyobb összefüggő területen a Tisza-tótól északra fekvő tájakon adódott. A Dunántúlon csak Szentgotthárd térségében haladta meg a sokéves átlagot a szeptemberi összeg (110-120%). A legnagyobb pozitív eltérés a Bükkben jelentkezett, a szokásosnak a kétszerese érkezett.